Η Διευθύνουσα Σύμβουλος του Οργανισμού είναι διπλωματούχος πολιτικός μηχανικός του Εθνικού Μετσόβειου Πολυτεχνείου και έχει εμπειρία πλέον των 25 ετών στην υλοποίηση αναπτυξιακών προγραμμάτων και δημοσίων έργων. Είναι ο νόμιμος εκπρόσωπος του Οργανισμού, έχουσα την αποκλειστική εξουσία και ευθύνη της διοικητικής λειτουργίας και οικονομικής διαχείρισης. Η Διευθύνουσα Σύμβουλος μπορεί να ορίσει με απόφασή της στέλεχος του Οργανισμού ως Γενικό Διευθυντή και να του μεταβιβάσει την άσκηση μέρους των αρμοδιοτήτων της. Έχει δε, οριστεί διατάκτης του προϋπολογισμού και υπογράφει κάθε σύμβαση για την ανάθεση υπηρεσιών, μελετών και έργων του Οργανισμού.