Η Εκτελεστική Επιτροπή είναι τριμελής και αποτελείται από τη Διευθύνουσα Σύμβουλο και δύο προϊσταμένους διευθύνσεων. Η Εκτελεστική Επιτροπή ασκεί κατ’ ελάχιστο τις ακόλουθες αρμοδιότητες:

• εγκρίνει τους όρους σύναψης και υλοποίησης προγραμματικών συμβάσεων,
• αποφασίζει για την κατάρτιση και δημοσίευση προσκλήσεων πρόσληψης έκτακτου προσωπικού για τις ανάγκες έκαστης προγραμματικής σύμβασης, καθώς και για τη δημοσίευση των πινάκων επιτυχόντων/απορριπτέων,
• συγκροτεί επιτροπές διαγωνισμών και διερεύνησης τιμών και εγκρίνει τα πρακτικά τους.